跨组学大数据研究中心
研究方向：
人脑胶质瘤的恶性进展分子机制研究
肿瘤异质性免疫微生物环境形成机制研究
胶质瘤及脑血管病健康医疗大数据及临床队列研究
脑胶质瘤跨组学大数据库建设及RNA组学调控研究
基于纳米微流控的脑脊液外泌体液体活检技术研发
跨组学数据整合的统计理论与方法研究
系统流行病学中多尺度高维因果中介分析的理论与统计方法研究
跨组学交互网络回归模型的构建及其统计推断方法研究
团队成员：
流动PI :
李刚 山东大学二级教授 泰山学者特聘教授 博士生导师 山东大学齐鲁医院神经外科主任
兼任山东省医学会神经外科分会副主任委员，山东省激光医学会副主任委员，山东省疼痛研究会外科镇痛分会委员，同时担任中华神经外科疾病研究杂志等多家杂志的编委。先后承担了国家自然科学基金、省自然基金、省科委、卫生厅及院级课题8项，获山东省科技进步一等奖及山东省十大科技成果奖各1项，获教育部提名国家科技进步二等奖1项，获山东省科技进步二、三等奖共7项，获山东省高校优秀科技成果一等奖2项，获山东省医学科技二等奖1项，获山东省优秀医学论文一等奖1项，获得国家实用新型专利2项。
固定PI:
袁中尚，生物统计学专业教授，博士生导师，概率论与数理统计专业博士毕业，第二批山东大学青年学者未来计划入选者，2009年5月-2009年6月参加了新加坡国立大学（NUS）基因组暑期班，2009年10月-2010年10月以国家公派联合培养博士生身份访问美国北卡大学（UNC-CH）生物统计系，2014年7月-2020年7月，在山东省临床医学研究院内分泌代谢研究所从事博士后研究，2017年10月-2019年12月在美国密歇根大学生物统计学系做访问学者。主要研究方向为跨组学数据分析与系统流行病学理论方法，生物医学数据的试验设计与统计分析方法，先后主持和承担了国家自然科学基金面上项目2项、国家自然科学基金青年项目，国家重点研发计划子课题1项，国家科技支撑计划子课题1项、山东省自然科学基金重大基础研究项目1项，中国博士后科学基金面上项目、山东省博士后创新专项等，以第一作者或通讯作者发表SCI论文19篇，成果先后发表在Nature Communications国际期刊，以及Statistics in Medicine, Human Molecular Genetics, Genetics等生物统计专业杂志，参编专著1部。
目前主持项目：
1.国家基金面上项目 系统流行病学中多尺度高维因果中介分析的理论与统计方法研究 (81872712), 2018.08-2022.12, 58万
2.国家基金面上项目 跨组学交互网络回归模型的构建及其统计推断方法研究 (81673272), 2016.08-2020.12, 50万元
3.省自然科学基金重大基础研究 支撑精准智能诊疗的跨组学大数据因果推断理论方法及其智能系统研究(ZR2019ZD02), 2019.12-2024.12, 216万元(项目负责人：袁中尚； 团队负责人：薛付忠)
4.第二批山东大学青年学者未来计划建设经费, 2016.07-2021.07, 50万元
5.国家重点研发计划子课题乳腺癌生物样本库及临床诊疗信息库建设, 2017.07-2021.07, 30.55万元
研究生：
刘璐
郭萍，张雅楠，王燕君
靳秀媛，鞠涛，张丽叶，韩佳沂
研究成果：
1. Yuan Z, Zhu H, Zeng P, Yang S, Sun S, Yang C, Liu J, Zhou X, Testing and controlling for horizontal pleiotropy with the probabilistic Mendelian randomization in transcriptome-wide association studies,Nature communications,11, 3861, doi:10.1038/s41467-020-17668-6 (2020).
2.Zhu Y+, Ji J+, Lin W, Li M, Liu L, Zhu H, Xue F, Li X, Zhou X,Yuan Z, MCC-SP: A powerful integration method for identification of causal pathways from genetic variants to complex disease,BMC Genetics21, 90, doi:10.1186/s12863-020-00899-3 (2020).
3.Lin W+, Ji J+, Zhu Y, Li M, Zhao J, Xue F,Yuan Z, PMINR: pointwise mutual information-based network regression – with application to study of lung cancer and Alzheimer’s disease,Frontiers in Genetics(2020).
4.Yu X+,Yuan Z+, et al. Relationship between birth weight and chronic kidney disease: evidence from systematics review and two-sample Mendelian randomization analysis,Hum Mol Genet. 2020; ddaa074. doi:10.1093/hmg/ddaa074
5.Liu L+, Zeng P+, Yang S,Yuan Z. Leveraging methylation to identify the potential causal genes associated with survival in lung adenocarcinoma and lung squamous cell carcinoma.Oncol Lett20, 193-200, doi:10.3892/ol.2020.11564 (2020).
6.Yuan Z, Ji J, Zhang T, Liu Y, Zhang X, Chen W, Xue F*. A novel chi-square statistic for detecting group differences between pathways in systems epidemiology.Stat Med.2016 Sep 7. doi: 10.1002/sim.7094.
7. Yuan Z,Yang, Y, Wang C. Liu J, Sun, X, Liu, Y. Xue F*. Trajectories of Long-Term Normal Fasting Plasma Glucose and Risk of Coronary Heart Disease: A Prospective Cohort Study.J Am Heart Assoc. 2018 Feb 13;7(4)
8.Yuan Z+, Ji J+, Zhang X, Xu J, Ma D, Xue F*. A powerful weighted statistic for detecting group differences of directed biological networks.Sci Rep.2016 Sep 30;6:34159.
9. Chu Y+,Yuan Z+, Meng M, Zhou H, Wang C, Yang G, Ren H. Red blood cell distribution width as a risk factor for inhospital mortality in obstetric patients admitted to an intensive care unit: a single centre retrospective cohort study.BMJ Open. 2017 Jun 21;7(6):e012849(co-first author)
10.Yuan Z+, Zhao M+, Zhang B+, Zhang H, Zhang X, Guan Q, Ning G, Gao L, Xue F, Zhao J Thyroid function modifies the association between ratio of triglyceride to high-density lipoprotein cholesterol and renal function: a multicenter cross-sectional study.Sci Rep.2015 Jul 16;5:11052
11.Yuan Z+, Gao Q＋, He Y, Zhang X, Li F, Zhao J, Xue F*.Detection for gene-gene co-association via kernel canonical correlation analysis.BMC Genet. 2012 Oct 8;13(1):83.
12.Yuan Z, Liu H, Zhang X, Li F, Zhao J, Zhang F, Xue F*. From interaction to co-association --a Fisher r-to-z transformation-based simple statistic for real world genome-wide association study.PLoS One. 2013 Jul 29;8(7):e70774.
13.Yuan, Z,Zhang X, Li F, Zhao J, Xue, F. Comparing partial least square approaches in gene-or region-based association study for multiple quantitative phenotypes.Human Biology. 2014 86(1):51-8.
14.Ji J＋, Yuan Z＋, Zhang X, Xue F. A powerful score-based statistical test for group difference in weighted biological networks.BMCBioinformatics. 2016 Feb 12;17(1):86.
15.Zhang X＋,Yuan Z＋, Ji J, Li H, Xue F. Network or regression-based methods for disease discrimination: a comparison study.BMC Med Res Methodol. 2016 Aug 18;16:100.
16. Xu J＋,Yuan Z＋, Ji J, Zhang , Li , Wu , Xue, Liu. A powerful score-based test statistic for detecting gene-gene co-association.BMC Genet. 2016 Jan 29;17(1):31.
17.Zhu L＋,Yuan Z＋, Wang X, Li J, Wang L, Liu Y, Xue F, Liu Y The Impact of Ambient Temperature on Childhood HFMD Incidence in Inland and Coastal Area: A Two-City Study in Shandong Province, China.Int J Environ Res Public Health. 2015 Jul 23;12(8):8691-704.
18.Gao N＋,Yuan Z＋,Tang X, Zhou X, Zhao M, Liu L, Ji J, Xue F, Ning G, Zhao J, Zhang H, Gao L. Prevalence of CHD-related metabolic comorbidity of diabetes mellitus in Northern Chinese adults: the REACTION study.J Diabetes Complications. 2015 Nov 24.
19.Yuan Z, Zou F*, Liu Y .Bayesian Multiple Quantitative Trait Loci Mapping for Recombinant Inbred Intercrosses.Genetics,188:189-195. 2011
20.杨青龙，马学敏，袁中尚*.带有辅助信息的多元失效时间数据的估计标准部分似然方法.中国科学,第42卷，第6期:563-577页，2012.（通讯作者）
